卷一脏腑经络先后病脉证第一痉湿病脉证并治第二卷二百合狐惑阴阳毒病脉证并治第三疟病脉证并治第四中风历节病脉证并治第五血痹虚劳病脉证并治第六肺痿肺痈咳嗽上气病脉证并治第七卷三奔豚气病脉证并治第八胸痹心痛短
黄庭内景五藏六府图
叙自叙凡例医学集成卷一阴阳诸论天地阴阳人身阴阳病有阴阳药有阴阳阴虚证论阳虚证论先天解说后天解说丹田解说五行生克五脏六腑脏腑表里脏腑所属足六经辨手六经辨十二经络寸关尺解六部脉解脉定至数脉定权衡浮沉统属（
序卷之一温邪门暑邪门伏暑门疟疾门痢疾门黄胆门卷之二中风门肝风痰火门虚劳门吐血门臌胀水肿门卷之三积聚门（附虫积）脘腹痛门噎膈反胃门三消门痰饮门痰喘门卷之四咳嗽门疝气门遗精淋浊门痉厥门杂病门妇人门产后门幼
难经经释
序卷一杂症述略卷二妇科述略胎前论治卷三产后述略
序叙自叙御定医宗金鉴麻疹卷一疹原轻重麻疹主治大法麻疹未出证治麻疹见形证治麻疹收没证治卷二身热不退烦渴谵妄喘急咳嗽喉痛失音牙疳呕吐泻泄痢疾腹痛衄血瘙疹盖痘疹瘾疹卷三 （附采诸家麻后证治）麻后龟胸麻后肺痿
自序凡例（六则）卷一 中风门中风（类中导入）卷二 诸伤门伤寒暑（参绪论暑证）湿（湿热）燥火伤饮食劳倦虚损（传尸）卷三 寒热门发热热潮热恶寒（背恶寒）振寒战栗寒热疟厥卷三 诸气门上气郁痞满腹满水
序各论人参防党参西洋参北沙参甘草黄精葳蕤黄芪白术苍术桔梗天麻秦艽柴胡前胡独活羌活防风升麻细辛远志金毛狗脊淫羊藿锁阳肉苁蓉白芨三七地榆丹参元参苦参龙胆草黄连胡黄连黄芩紫草知母贝母白头翁白前白薇白鲜皮白茅
卷一活幼指南赋慈幼敬心赋卷二小儿总治法小儿初生脐风小儿变蒸小儿胎疾小儿五脏部位五脏外症看小儿虎口纹脉法小儿夜啼惊风吐泻痢疾小儿疟疾咳嗽疳痨伤食伤风浮肿口疮疥疮染症五脏外症五软病症卷三水镜诀指掌形图入门