医方歌括
简介序凡例卷一卷二卷三卷四卷五卷六卷七
简介序卷上卷中卷下附录
妇科百辩
上品卷第一玉屑玉泉丹砂水银空青曾青白青扁青石胆云母朴硝硝石矾石芒硝滑石紫石英白石英青石脂赤石脂黄石脂白石脂黑石脂太一禹余粮禹余粮青玉白玉髓璧玉合玉石陵石碧石青五羽石石流青石流赤六芝赤箭龙眼猪苓茯苓茯神
自序卷之一·治法通论卷之一·调经门经候总论经闭血崩赤白带下白浊白淫卷之二·杂症门上（杂证男女一也。此二卷方论，出女科书，多杂病书所遗，故存之耳。）虚劳客热寒热恶寒中风飞尸血厥螈颤振惊悸颠狂血风烦闷血风
秘藏膏丹丸散方剂
洄溪医案
序产后总论胞衣不下块痛血崩血晕手足厥冷类伤寒类中风类疟妄言妄见气短发喘咳嗽自汗盗汗大便不通小便不通呕吐不纳谷伤食膨胀泄泻痢疾烦闷产后调护法
叙上卷一、太极图抄引二、太极图（图缺）三、太极图说四、不知《易》者不足以言太医论五、问三才所同者于人身何以见之六、命门图说（图缺）七、右肾水火辩九、《难经正义》三焦评附：东垣三焦论十、问诊三焦包络十一