序序论第一果实第二（二十九条）菜蔬第三（五十八条）谷米第四（二十七条）鸟兽第五（四十条）
序序卷一太阳篇卷二阳明篇卷三少阳篇卷四太阴篇卷五少阴篇卷六厥阴篇
万氏家传养生四要
明堂灸经
黄帝内经灵枢
序一序二集解序卷上诊候入式歌五脏歌心脏歌一心脏歌二心脏歌三肝脏歌一肝脏歌二肝脏歌三脾脏歌一脾脏歌二脾脏歌三肺脏歌一肺脏歌二肺脏歌三肾脏歌一肾脏歌二肾脏歌三左右手分诊五脏四时脉歌左手寸口心脉歌左手关部肝
治愈半身不遂一例治愈智迟一例治愈胆虚一例治愈呆病一例治愈高热一例治愈胃脘痛一例治愈梅核气一例治愈脏躁一例治愈偏枯一例治头风一例
进表卷一治诸风（附香港脚）至宝丹灵宝丹润体丸乌犀丸牛黄清心丸摩挲丸透冰丹龙脑天麻煎牛黄小乌犀丸娄金丸龙虎丹麝香天麻丸龙脑芎犀丸银液丹和太师牛黄丸碧霞丹雄朱丸八风丹牛黄生犀丸辰砂天麻丸青州白丸子辰砂丸牛
《滇南本草》序一《滇南本草》抄本跋《滇南本草》抄本后序重刊《滇南本草》序《滇南本草》序二第一卷石莲花木贼贯众七星草石苇白果松节、松笔头、松香、地盘松球侧柏叶玉兰花野棉花云连白芍、赤芍牡丹皮鸡头实荷叶藕
卷一十二经循行部位歌头前正面歌头后项颈歌胸腹脊背图手膊臂外内歌足膝外内歌肺经歌大肠经歌胃经歌脾经歌心经歌小肠经歌膀胱经歌肾经歌心包络经歌三焦经歌胆经歌肝经歌任脉歌督脉歌脉诀十二经气血多少歌痈疽总论歌痈