卷首集例先天图说天地人物气候相应说天地人物气候相应图释方历代医学姓氏三代以前，圣君贤相，创为医药，以济死生者也。秦汉以后，有通经博史，修身慎行，闻人巨儒，兼通乎医。医极其明者也。以医为业，世代相承者也
石山医案
医方歌括
针邪密要
刻针灸问对叙序卷之上卷之中三才法候气法十四法卷之下十五络脉歌周身经穴相去分寸歌肺经大肠经胃经脾经心经小肠经肾经膀胱经心包络经三焦经胆经肝经督脉任脉经穴起止歌十二经纳支干歌天心十一穴歌经脉交会八穴歌八会
简介序卷第一卷第二卷第三卷第四卷第五卷第六卷第七卷第八
卷上春温时疠湿温暑燥病寒病冬温疟疾卷下女科幼科痘科痧疹外科
徐序自序卷上脏腑经络先后病脉证第一痉湿病脉证治第二百合狐惑阴阳毒病证治第三疟病脉证并治第四中风历节病脉证并治第五血痹虚劳病脉证并治第六肺痿肺痈咳嗽上气病脉证治第七卷中奔豚气病脉证治第八胸痹心痛短气病脉
自序卷之一·治法通论卷之一·调经门经候总论经闭血崩赤白带下白浊白淫卷之二·杂症门上（杂证男女一也。此二卷方论，出女科书，多杂病书所遗，故存之耳。）虚劳客热寒热恶寒中风飞尸血厥螈颤振惊悸颠狂血风烦闷血风
黄帝内经素问序重广补注黄帝内经素问序自序新刻叙卷一 养生上古天真论一四气调神论二金匮真言论三生气通天论四阴阳应象论五卷二 脏象十二脏相使论六五脏别论七五脏生成论八脏气法时论九宣明五气十卷二 脉法经脉别