卷首集例先天图说天地人物气候相应说天地人物气候相应图释方历代医学姓氏三代以前，圣君贤相，创为医药，以济死生者也。秦汉以后，有通经博史，修身慎行，闻人巨儒，兼通乎医。医极其明者也。以医为业，世代相承者也
自叙上卷原病温疫初起传变不常急证急攻表里分传热邪散漫内壅不汗下后脉浮下后脉复沉邪气复聚下后身反热下后脉反数因证数攻病愈结存下格注意逐邪勿拘结粪蓄血发黄邪在胸膈辨明伤寒时疫发斑战汗合论战汗自汗盗汗狂汗发
自叙卷一草部苍术黄精益智仁草豆蔻缩砂仁补骨脂肉豆蔻胡芦巴白豆蔻红豆蔻大茴香香附荜拨藿香香薷荜澄茄使君子威灵仙白附子慈菰牵牛子何首乌肉苁蓉锁阳丹参泽兰益母草刘寄奴延胡索胭脂（艹/閶）茹姜黄地榆三七蒲黄续
简介序新校正补注内经素问表凡例内篇 卷之一内篇 卷之二内篇 卷之三外篇 卷之四外篇 卷之五外篇 卷之六外篇 卷之七外篇 卷之八外篇 卷之九
简介细目序言上卷中卷下卷
简介序卷01卷02卷03卷04卷05卷06卷07卷08卷09卷10卷11卷12卷13卷14卷15卷16卷17卷18卷19卷20卷21卷22卷23卷24
卷一明目赋（一）眼科论孙真人谕眼论阴阳相应辨论上古天真论眼科通明论轩辕黄帝说眼病目科四季五行发挥妙诀明目赋（二）太玄真人论眼病五轮所属太玄真人问眼病因论八廓所属八卦也论五轮受病之因论八廓受实热病之因论
卷一妇女逐年经症室女十三四岁行经室女十五六岁妇女十七八岁妇人十九二十嫁出时妇人二十一二妇人二十三四妇人二十五六妇人二十七八妇人二十九三十妇人三十四五妇人三十六七妇人三十八九妇人五十一二卷二诊妇人有孕论
叙卷之一调经总论经候卷之二血崩带下淋浊卷之三妊娠临蓐卷之四产后
序（一）自记序（二）重刻外科证治弁言凡例卷一痈疽证治统论痈疽部位名记胃气论论肿论溃论敛论痛论痒五善歌七恶歌饮食宜忌论阳痈证治则例阴疽证治则例烂溃不敛治法翻花起肛治法患孔毒根治法漏管治法多骨治法毒瓦斯攻