自叙卷上·经络脏腑无气存亡论躯壳经络脏腑论表里上下论阴阳升降论治病必分经络脏腑论治病不必分经络脏腑论肾藏精论一脏一腑先绝论君火相火论卷上·脉诊脉决死生论症脉轻重论脉症与病相反论卷上·病中风论臌膈论寒热
简介水·火·土·金·石部草部木部果·米谷·菜·人部兽·虫鱼部用药凡例煎药则例·服药序次·服药禁忌妊娠服禁·六陈·十八反当禁不禁犯禁必死·不必忌而忌之过
序卷上辨阴证阳证辨脉辨寒热辨外感八风之邪辨手心手背辨口鼻辨气少气盛辨头痛辨筋骨四肢辨外伤不恶食辨渴与不渴辨劳役受病表虚不作表实治之辨证与中热颇相似卷中饮食劳倦论补中益气汤立方本指朱砂安神丸四时用药加减
序卷之一风病诸候上（凡二十九论）一、中风候二、风候三、风口噤候四、风舌强不得语候五、风失音不语候六、贼风候七、风痉候八、风角弓反张候九、风口候十、柔风候十一、风痱候十二、风退候十三、风偏枯候十四、风四
灵枢九针十二原第一法本输第二法地小针解第三法人邪气藏府病形第四法时根结第五法音寿天刚柔第六法律官针第七法星本神第八法民终站第九法野经脉第十经别第十一经水第十二经筋第十三骨度第十四五十营第十五营气第十六
《回生集》原叙重刻《回生集》叙卷上内症门吕祖师铁拐杖方无比山药丸萆汤还童酒方老人喘嗽三子养亲汤十子丸种子奇方壮阳种子丸蛔厥心疼急心气疼卒急心疼擦牙乌须不老神方齿衄治牙疼神效方治风火牙疼熏虫牙痛方牙痛噙
金匮玉函要略方论序金匮要略序（出赵本．）金匮玉函要略综概卷一脏腑经络先后病脉证第一（论十三首、脉证三条）湿病脉证第二（论一首、脉证十二条、方十一首）百合狐惑阴阳毒病证治第三（论一首、证三条、方十二首）
秘传外科方
自序凡例卷一月经治月经病方卷二胎前治胎前病方秦氏世传逐月养胎方卷三小产治小产病方临产治临产病方附前人治临产效方卷四产后治产后病方卷五带下治滞下病方崩漏治崩漏病方附录前人治临产效方卷六妇女杂病治妇女杂病
序卷一初诞法护养法噤风撮口脐风脉法变蒸肝脏心脏脾脏肺脏肾脏卷二面上症发搐目睛动唇口蠕动惊搐目直睡中惊动目动咬牙摇头便血偏风口噤角弓反张卷三急惊慢惊惊痫惊风天钓内钓盘肠气痛胎惊胎风五软五硬卷四风热风症痉