徐序自序卷上脏腑经络先后病脉证第一痉湿病脉证治第二百合狐惑阴阳毒病证治第三疟病脉证并治第四中风历节病脉证并治第五血痹虚劳病脉证并治第六肺痿肺痈咳嗽上气病脉证治第七卷中奔豚气病脉证治第八胸痹心痛短气病脉
张序卷首保产卷一禀赋脏能脉候胎病胎热胎寒胎肥胎怯胎黄胎惊锁肚不啼不乳脐风撮口噤口变蒸卷二杂症咽喉齿舌口耳目鼻囟颐脐语迟夜啼龟胸龟背鹤节行迟五软五硬卷三痘疮总诀卷四痘疮发热三日诀见点三日诀卷五痘疮起胀三
卷一/太阳篇上辨列太阳条例大意太阳正治法第一太阳病脉证三条桂枝汤脉证七条桂枝汤禁三条麻黄汤脉证七条合病证治六条辨伤寒受病阴阳不同一条太阳病愈时日及欲解之候与传经之证六条太阳权变法第二不可发汗例十条桂枝
卷上胎前恶阻子烦子悬子肿子满子气子喑子痫子淋子嗽子疟心腹痛腰胁痛下血尿血转胞胎气上逼脏躁胎动胎痛孤浆吐血伤寒痢疾泄泻霍乱伤食盅鸣堕胎胎不长鬼胎伤胎肠覃石瘕卷中产后难产胎衣不下血晕厥恶露不下恶露不绝血崩
序序八穴灸法头部二穴手部二穴背腹部二穴足部二穴梓桑君针道传宗图（缺）百穴法歌折量法补泻手法穴法图寅手太阴肺经卯手阳明大肠经辰足阳明胃经巳足太阴脾经午手少阴心经未手太阳小肠经申足太阳膀胱经酉足少阴肾经戌
赠万密斋先生医书序叙叙万氏幼科源流卷之一总论大法附方卷之二背图形八症（一）？脑发？腮上背发中背发下背发腰背发暗发（骑马痈）卷之三背图形八症（二）对口正背发上搭手中搭手囊发蛇头疔蛇头疔天蛇头毒膝发卷之四
巢氏诸病源候总论
卷上太阳方总论卷下阳明方总论少阳方总论太阴方总论少阴方总论厥阴方总论六经方余论
伤寒兼证析义
黄帝内经素问序重广补注黄帝内经素问序自序新刻叙卷一 养生上古天真论一四气调神论二金匮真言论三生气通天论四阴阳应象论五卷二 脏象十二脏相使论六五脏别论七五脏生成论八脏气法时论九宣明五气十卷二 脉法经脉别