正文以上发明病根，是本段之前半截。下乃备引经义，以证其实而足其理。以上论理升降出入，是病机也。推病根，为第二段。以上推论化气，发明标本，是补足前半篇义理，为第三段。以下论五味补泻治法，退出通篇，为第四
凡例八则卷一总论脉学源流定脉部位尺寸解六部脉解左心膻中肝胆肾小肠、右肺胸中脾胃命大肠·辨定至数二十七脉名目有胃气者生脉贵有神读缓字法四时平脉浮、沉、迟、数四大纲浮沉迟数对待总论微与细对微细虚与实对虚实
叙卷上伤寒论难读并宜补大旨三阳三阴分经名义伤寒重病多是下焦伏寒伏寒触发与伤寒时温脉证并病机异同即病伏气直中传经四证异同晚发是伤寒正病两感有三水气凌心即是三焦伤伤寒杂病皆有之无端暴喘即是寒入命门伤寒杂病
序序卷一太阳篇卷二阳明篇卷三少阳篇卷四太阴篇卷五少阴篇卷六厥阴篇
修订说明写在卷首诊脉传心诀诸脉主病诊脉总要诊脉六法三部总看歌发言须当理引经药用药传心赋治病主药诀四君汤加减歌四物汤加减歌二陈汤加减歌小柴胡汤加减歌平胃散加减歌病因赋百病皆生于六气诸症莫逃乎四因伤寒症传
叙自叙凡例医学集成卷一阴阳诸论天地阴阳人身阴阳病有阴阳药有阴阳阴虚证论阳虚证论先天解说后天解说丹田解说五行生克五脏六腑脏腑表里脏腑所属足六经辨手六经辨十二经络寸关尺解六部脉解脉定至数脉定权衡浮沉统属（
简介卷之上卷之下
简介噎隔门翻胃门气症门伤风门伤寒门中寒门中风门伤暑门伤湿门黄疸门火 门心痛门面肿门头痛门头晕门耳病门目疾门鼻病门咽喉门牙齿门胁痛门背痛门脾胃门腹痛门腰痛门疝气门脚气门女科门幼科门痘科门外科附录外科补遗
自序序论脏象论经络次序论经络浅深论奇经八脉论总论宗气论营气论卫气论脉诀论病因论中风论八风论轻重论寒热论证候论风脉论治法论药饵附案
自序卷上痈疽原委论痈疽治法总论治病则例歌痈疽灸法并禁灸疮穴论病生死法察形色顺逆病有三因受病主治不同论调理须知杂忌须知疮疡看法肿疡治法溃疡治法痈疽诸症疮名十律炼元明粉法取蟾酥法制附子法制炒诸药仙方活命饮