嘱言上编总论歌痈疽总论痈疽总论歌痈疽总论歌解痈疽阳症歌痈疽阴症歌阴阳相半歌痈疽善恶歌痈疽五善歌痈疽七恶歌诸般坏症歌中编处方篇锅烈制法金丹制法石青制法银翠制法附∶灵药释性第一方·中九丸第二方·金蚣丸第三
素问六气玄珠密语
醉花窗医案
《卫生易简方》序进《卫生易简方》表稿卷之一诸风诸寒诸暑诸湿伤寒卷之二头风头痛眩晕霍乱呕吐泄泻诸痢诸疟脾胃五噎反胃咳嗽卷之三痰饮喘急咳逆诸气疝气心痛腰胁痛发痧脚气五痹五疸卷之四虚劳骨蒸劳瘵泄精赤白浊吐血
内外伤寒辩惑论
自叙卷一草部苍术黄精益智仁草豆蔻缩砂仁补骨脂肉豆蔻胡芦巴白豆蔻红豆蔻大茴香香附荜拨藿香香薷荜澄茄使君子威灵仙白附子慈菰牵牛子何首乌肉苁蓉锁阳丹参泽兰益母草刘寄奴延胡索胭脂（艹/閶）茹姜黄地榆三七蒲黄续
第1部分第2部分第3部分
叙凡例补益之剂（十首、附方七）四君子汤升阳益胃黄鳖甲秦艽鳖甲秦艽扶羸汤紫菀汤百合固金补肺阿胶小建中汤益气聪明汤发表之剂（十四首、附方八）麻黄汤桂枝汤大青龙汤小青龙汤葛根汤升麻葛根汤九味羌活十神汤神术散
上卷总论类妇人九证论难易上卷经脉类经脉之本经脉诸脏病因经不调调经论外备用方血热经早血热论外方血热经迟血寒经迟血寒论外方血虚经乱肾虚经乱经期腹痛经痛论外方崩淋经漏不止治崩淋经漏之法崩漏论外方杀血心痛热入
《本草衍义》提要序卷一序例上衍义总叙卷二序例中卷三序例下内容卷四玉泉丹砂空青绿青云母石钟乳朴硝芒硝硝石英硝矾石滑石紫石英白石英赤石脂白石脂石中黄子婆娑石无名异菩萨石卷五金屑银屑水银水银粉雄黄雌黄石硫黄