原序卷上中风卒中疟痰喘泻水肿鼓胀胀脾胃伤食积聚诸气诸血证出血不止呕血眩晕头痛脑痛牙疼心痛卷下目痛口糜身重胁痛腰痛虚损劳瘵梦遗不得卧妄见发热渴盗汗白浊淋小便不通大便不通疝痔论附骨疽乳痈子嗣
序新刻药鉴卷之一寒热温平四赋，增补东垣未尽之意药性（寒门）药性（热门）药性（温门）药性（平门）新刻药鉴卷之一用药分根梢制药资水火用药丸散例解药毒法用药生熟法药性阴阳论病症标本论取方之法论各经补泻及专主
序一序二卷上例言卷上杂症中风章伤风章中寒章暑病章注夏章湿症章火症章内伤章伤食章六郁章气病章痰病章咳嗽章干咳喘病章哮病章疟病章霍乱章泄泻章痢疾章呃逆章卷中杂症痞块积聚章呕吐恶心章噎膈反胃章吞酸吐酸章水肿
卷上勿药须知疗心法言林鉴堂安心诗养心说养肝说养脾说养肺说养肾说斋说食忌说食饮以宜居室安处论居处宜忌说寝室宜忌说卧时祝法睡诀孙真人卫生歌真西山卫生歌养神气铭孙真人养生铭谨疾箴导引却病法内养下手诀运气法固
管序黄序总论十二时气血流注歌发散方十三味总方十四味加减方七厘散飞龙夺命丹地鳖紫金丹三十六大穴图说少林寺秘传内外损伤主方损伤补药方王瑞柏损伤用药论十全大补汤四物汤四君子汤八珍汤补中益气汤六君子汤加味承气
易牙遗意
第1部分第2部分第3部分第4部分第5部分
药性歌括四百味
序卷上疮科总论五发痈疽论五发痈疽通治方疔疮论瘰论卷下肠痈痔论乳痈论肺痈论诸疳疮论附骨疽论诸疮论疥癣论瘿瘤论疮论便毒论
序序序序自序卷上参合六十年客气旁通图运气便览五运六气寸尺不应药之主宰运气之变成疾论四时运气论疫与伤寒似同而异论伤寒无斑疹疫疹穷源疫疹案论疫疹之脉不宜表下论疫疹因乎气运疫疹之症头痛倾侧骨节烦痛腰如被杖遍