卷一卷一伤寒传经从阳化热从阴化寒原委太阳风邪伤卫脉证太阳寒邪伤营脉证风寒营卫同病脉证误服三汤致变救逆三阳受病传经欲愈脉证阳明表病脉证阳明热病脉证阳明腑病脉证阳明慎汗慎清慎下少阳脉证少阳病用柴胡汤加减法
叙自叙凡例医学集成卷一阴阳诸论天地阴阳人身阴阳病有阴阳药有阴阳阴虚证论阳虚证论先天解说后天解说丹田解说五行生克五脏六腑脏腑表里脏腑所属足六经辨手六经辨十二经络寸关尺解六部脉解脉定至数脉定权衡浮沉统属（
序凡例卷之一医学或问中风附∶胃风伤寒卷之二瘟疫斑疹内伤中暑湿证燥证火热郁证痰饮咳嗽哮喘疟证霍乱泄泻卷之三痢呕吐噎膈HT逆吞酸嘈杂嗳气痞满肿胀积聚虚损劳极卷之四眩运头痛胃脘痛腹痛腰痛胁痛诸气疝气香港脚痛
石山医案
古今名医方论
尚论篇
卷一月经前期论（一）月经后期论（二）月经或前或后（三）卷二脉法辨孕男女脉法歌调经经闭崩漏赤白带安胎漏胎胎痛恶阻胎肿子烦子痫子悬子淋胎死上喘胎衣不下产后寒热产后血晕产后腹痛阴户脱卷三调经种子崩漏论赤白带
卷一医经(一)卷二医经（二）卷三医经（三）卷四医经（四）卷五医经（五）卷六医经(六)卷七医经（七）卷八医经（八）卷九本草（一）卷十本草（二）卷十一本草（三）卷十二本草（四）卷十三本草（五）卷十四本草（
湖岳村叟医案
卷上论疮肿诊候入式法论荣卫色脉参应之法论持手诀消息法论三部所主脏腑病证论脉证名状二十六种所主病证论三部脉所主证候论三部脉所主杂病法诀论诊候肺疽肺痿法论将护忌慎法论疮疽肿虚实法辨疮肿浅深法辨脓法辨疮疽疖