卷上太阳方总论卷下阳明方总论少阳方总论太阴方总论少阴方总论厥阴方总论六经方余论
修订说明写在卷首诊脉传心诀诸脉主病诊脉总要诊脉六法三部总看歌发言须当理引经药用药传心赋治病主药诀四君汤加减歌四物汤加减歌二陈汤加减歌小柴胡汤加减歌平胃散加减歌病因赋百病皆生于六气诸症莫逃乎四因伤寒症传
卷首集例先天图说天地人物气候相应说天地人物气候相应图释方历代医学姓氏三代以前，圣君贤相，创为医药，以济死生者也。秦汉以后，有通经博史，修身慎行，闻人巨儒，兼通乎医。医极其明者也。以医为业，世代相承者也
序卷上总论指南赋入门察色五视法面上诸穴歌小儿无患歌调护歌入门候歌入门试法四十九脉图解详解脉纹辨色歌五指冷热歌审候歌脉法歌闻小儿声音辨小儿五音阳掌十八穴疗病诀阴掌九穴疗病诀附臂上五穴疗病诀足部十三穴疗病
妙一斋医学正印种子编
正文浮沉迟数滑涩附载人迎气口脉法附载奇经八脉
小引续印《产科心法》之缘起李序原序蔡序上集种子门种子方法种子歌胎前门胎产医法总论胎产医法总论胎产医法总论验胎之法孕妇忌食药忌恶阻胎动不安漏胎半产子烦子悬子眩子痫子肿子呛子鸣子喑子淋小便不通孕悲尿血乳泣
自序再自序合论诸书之得失以示初学之从违（四条）论读医书之难论诊病须知四诊论《景岳全书》论金匮肾气汤论倪涵初先生疟痢三方附录王子圣大归芍汤张洁古芍药汤附论噤口痢论吴又可《温疫论》（四条）论时邪论初诊用药
序风温夹食时湿温暑风兼疹暑湿白红疹紫斑春温逆入心包伏暑伏暑内闭热入营分热入厥阴热邪消烁津液阴虚阳浮阴斑伏暑夹食霍乱夹食霍乱遗湿风斑寒水袭肺内燥冬温痰火暑风化疟阴疟肝胃瘅疟气虚下陷暑湿泄泻脾虚泄泻白积暑
叙上卷一、太极图抄引二、太极图（图缺）三、太极图说四、不知《易》者不足以言太医论五、问三才所同者于人身何以见之六、命门图说（图缺）七、右肾水火辩九、《难经正义》三焦评附：东垣三焦论十、问诊三焦包络十一