卷首集例先天图说天地人物气候相应说天地人物气候相应图释方历代医学姓氏三代以前，圣君贤相，创为医药，以济死生者也。秦汉以后，有通经博史，修身慎行，闻人巨儒，兼通乎医。医极其明者也。以医为业，世代相承者也
产宝诸方
简介噎隔门翻胃门气症门伤风门伤寒门中寒门中风门伤暑门伤湿门黄疸门火 门心痛门面肿门头痛门头晕门耳病门目疾门鼻病门咽喉门牙齿门胁痛门背痛门脾胃门腹痛门腰痛门疝气门脚气门女科门幼科门痘科门外科附录外科补遗
正文太虚理气天地阴阳歌五行质气生克制化歌运气合脏腑十二经络歌主运歌主气歌客运歌客气司天在泉间气歌运气分主节令歌五音主客太少相生歌五运齐化兼化六气正化对化歌六十年运气上下相临歌起主客定位指掌歌天符太乙天
《评琴书屋医略》提要自叙凡例序附诗并各题赠卷一外感症春日外感夏日外感秋日外感冬日外感春温症(冬温同论症治)暑症附案(暑邪变疟)湿症泄泻症痢症附论时行传染二症疟症附案(暑邪变疟)又案(疟后辨寒热)卷二消
前言卷第一摄生之一（佚）卷第二摄生之二（卷末缺）顺养六气九气调食寿限卷第三阴阳阴阳大论调阴阳阴阳杂说卷第四（佚）卷第五（卷首缺）人合阴阳合四海合十二水卷第六（卷首缺）脏腑之一五脏命分脏腑应候脏腑气液卷
脉诀
普济本事方续集
序一序二序三卷一卷二卷三疹痧疹附录吴山散记小引吴山散记
序凡例卷一卷二卷三卷四卷五卷六卷七卷八卷九卷十附录附录