序（一）自记序（二）重刻外科证治弁言凡例卷一痈疽证治统论痈疽部位名记胃气论论肿论溃论敛论痛论痒五善歌七恶歌饮食宜忌论阳痈证治则例阴疽证治则例烂溃不敛治法翻花起肛治法患孔毒根治法漏管治法多骨治法毒瓦斯攻
中寒论辩证广注
推篷寤语
脉诀
卷一 新着脉法心要部位胃脉浮脉沉脉数脉迟脉长脉短脉大脉小脉洪脉微脉实脉虚脉紧脉缓脉芤脉濡脉弦脉弱脉滑脉涩脉动脉伏脉促脉结脉革脉牢脉疾脉细脉代脉散脉奇经八脉冲阳等脉五脏死脉对待比类纲目以脉主病脉真从脉症
兰室秘藏
自序原病篇卷一·上焦篇风温、温热、温疫、温毒、冬温暑温伏暑湿温、寒湿温疟秋燥补秋燥胜气论卷二·中焦篇风温、温热、温疫、温毒、冬温暑温、伏暑寒湿湿温秋燥卷三·下焦篇风温、温热、温疫、温毒、冬温暑温、伏暑
王序卷一四明心法（上）诊法脉义二十五方总图二十五方分图二十五方图解二十五方主症卷二四明心法（中）方论药论卷三四明心法（下）中风伤寒疟疾痢疾鼓症膈症吞酸眩晕咳嗽怔忡血症弱症消症霍乱胃脘痛胎前产后带下淋症
简介卷一卷二卷三卷四卷五卷六卷七卷八
叙上卷一、太极图抄引二、太极图（图缺）三、太极图说四、不知《易》者不足以言太医论五、问三才所同者于人身何以见之六、命门图说（图缺）七、右肾水火辩九、《难经正义》三焦评附：东垣三焦论十、问诊三焦包络十一