赵序吴序卷一阴阳脏腑亢害承制卷二望色切脉辨证施治卷三二十六字符机理固润涩通塞清扬逆从求责缓峻探兼候夺寒热补泻提越应验卷四用药权衡炮制心法卷五古经解卷五古方解十全大补汤·八珍汤归脾汤补中益气汤四君子汤四
养生三要
产育宝庆集
石山医案
医方歌括
难经集注
叙卷一肿疡（谓疮疡未出脓者）溃疡(谓疮疡已出脓者)溃疡作痛卷二溃疡发热(附恶寒)发背脑疽卷三鬓疽时毒(谓毒发于面鼻耳项)疔疮臀痈(附腿痈并腿痛香港脚)卷四脱疽肺痈肺痿肠痈卷五瘰流注疮疡作渴作呕卷六咽喉
序总论（共百字二十句五言）〔附一〕治眼九法〔附二〕茹穹子入道始终入手（一）身法得手进步入手（二）进步数息调息胎息丘真人呼吸歌
序叙自叙御定医宗金鉴麻疹卷一疹原轻重麻疹主治大法麻疹未出证治麻疹见形证治麻疹收没证治卷二身热不退烦渴谵妄喘急咳嗽喉痛失音牙疳呕吐泻泄痢疾腹痛衄血瘙疹盖痘疹瘾疹卷三 （附采诸家麻后证治）麻后龟胸麻后肺痿
卷首序奏玉帝青辞进医书表卷上当明经络须识扶阳住世之法大病宜灸三世扁鹊时医三错忌用转下禁戒寒凉要知缓急五等虚实黄帝灸法扁鹊灸法附∶窦材灸法卷中伤寒伤寒四经见证太阳见证阳明见证太阴见证少阴见证伤风伤寒挟食