《仁斋直指》序卷之一总论五脏所主论五脏病证虚实论诸阴诸阳论血营气卫论脉病逆顺论男女气血则一论问病论论《易简方论》附∶原脉论（出《保命集》）附论五篇（出《丹溪心法》）附∶十二经脉歌火湿分治论虚实分治论附
自序赵序辛序凡例卷之一·杂症脏腑说心包络三焦说五脏配五行八卦说水火说命门说五脏生克说五邪说十二经配三阳三阴说六气说六气后论运气说虚实寒热说补泻论反治论标本说表里论阴阳论夏月伏阴辨气气之病证脉治法血吐血
自序序一序二序三序四序五凡例卷一·医学溯源养生稽古阴阳水火生克运气运气总论十二化五运歌十二支年六气歌流年起六气歌客气交日歌逐年主气歌逐年客气歌脏腑（附：腔子、脂膜）脏象应天地脏腑贵贱脏腑命名释义脏腑相
张序卷之上一、天地六位脏象图（图缺）二、手足阴阳（一）手足三阴三阳（二）手三阴三阳（三）足三阴三阳三、五脏六腑，除心包络十一经脉证法（一）肝之经，肝脉本部在于筋，足厥阴，风，乙木也。（二）胆之经，足少
伤寒心境别集
明堂灸经
简介序上卷中卷下卷
序卷一风温温疫卷二暑温伏暑温毒湿温冬温卷三中风少阳螈肝风肝厥胁痛肝痈癫狂虚劳吐血便血肿胀单腹胀滞下（俗名痢疾，又曰积。红色属热，属血，白色属寒、属气。）积聚淋浊泄泻卷四痘症噎呕吐反胃哕失音水气寒湿痹风
孙序徐序沈序卷一华佗论病理神方一○○一·论人法与天地一○○二·论阴阳大要一○○三·论生成一○○四·论阳厥一○○五·论阴厥一○○六·论阴阳痞格一○○七·论寒热一○○八·论虚实大要一○○九·论上下不宁一○
序卷一杂症述略卷二妇科述略胎前论治卷三产后述略