序卷上全论大法第一六经正义第二合并启微第三风寒辨惑第四温暑指归第五湿异同第六平脉准绳第七卷下大阳病解第一阳明病解第二少阳病解第三太阴病解第四少阴病解第五厥阴病解第六制方大法第七
叙一叙二叙三自叙卷上诸论辨正徐洄溪先生医者误人无罪论读王孟英治张养之久病伏邪医案论临症必先读书论治病当悉未病论烟痢宜通不宜塞论萝卜缨为治痢妙药论痰症随宜施治论治喉症宜分三大纲论喉症吹药论推摩法论治小儿
医林琐语
辨症玉函
序叙论痈疽发背第一服药通变方第二荣卫返魂汤用敷贴温药第三冲和仙膏敷贴热药第四回阳玉龙膏敷贴凉药第五洪宝丹合用诸方第六黄矾丸柞木饮子三石散栝蒌散真君妙贴散追风丸搜损寻痛丸复煎散神锋散乌金散索血散葛根汤散
卷上第一问 精血以分男女之本源第二问 古法男子三十而娶女子二十而嫁第三问 妇人感病倍于男子第四问 何以谓之天癸第五问 何以谓之经候第六问 经候或前或后多寡不定第七问 月水根据时来不快利第八问 经水欲行
弁言序调经门总论精血论养血论调气论辨色论多少论先期后期论居经论泄泻论身痛论痛经论经漏论不利论过期论经闭论枯血论血劳论血崩论痰气污血论杀血心痛论带下论白浊白淫论虚劳门冷劳热劳骨蒸劳血风劳胎前门总论胎前调
重刊宋本洪氏集验方序重刊宋本洪氏集验方后叙卷第一治痢肉豆蔻散祛疟散大交泰丹混元胎丹还少丹琼玉膏一粒金丹神妙六逸丸铁瓮申先生交感丹降气汤牙药卷第二（痈疽）化毒排脓内补散神授痈疽灵方治乳痈发背，诸般疮毒灵
序序例第一案~第九案第十案~第十九案第二十案~第二十九案第三十案~第三十九案第四十案~第四十九案后记
卷上详注灵枢素问伏气化温诸条详注难经伏气发温诸条详注仲景伏气化温证治各条附注仲景暴感暑热证治各条附注仲景兼感湿温证治各条卷中辨正周禹载温热暑疫各条辨正蒋问斋医略伏邪篇辨正张石顽伤寒绪论温热各条辨正吴又