序凡例原叙卷首诊法五脏六腑经气望色闻声问证切脉卷一证治背上头骨两耳眼目唇口鼻孔齿牙舌本咽喉胸前大腹小腹胁肋腰中手臂脚腿前阴后阴大便小便卷二证治寒热呕吐咳嗽喘失血遗精言语心神斑黄出汗肿胀饮食起居倒仆掣动
凌门传授铜人指穴
总论各论温病大纲逆传入营流连气分邪留三焦里结阳明卫、气、营、血看法论湿邪察舌白苔黄苔绛舌紫舌淡红舌黑苔验齿辨斑疹辨白疹论妇人温病
叙万氏幼科源流序卷之一形气发微论原病论入门审候歌观面部五脏形歌观面部五色歌三关脉纹变见歌小儿正诀指南赋胎疾脐风变蒸变蒸兼证幼疾五脏诸证肝经主病肝经兼证肝所生病急慢惊风急惊风有三因卷之二急惊风证急惊风变
序一序二集解序卷上诊候入式歌五脏歌心脏歌一心脏歌二心脏歌三肝脏歌一肝脏歌二肝脏歌三脾脏歌一脾脏歌二脾脏歌三肺脏歌一肺脏歌二肺脏歌三肾脏歌一肾脏歌二肾脏歌三左右手分诊五脏四时脉歌左手寸口心脉歌左手关部肝
自序卷一调经门经水先期而来经水过期而来经行腹痛血风卷二血崩便浊白淫淋证白带血癖经准不孕热入血室卷三广嗣论胎前门受妊脉法男女脉法双胎脉法死胎脉法鬼胎脉法逐月胎形论妊娠调护法小产安胎卷四妊娠中风妊娠伤寒妊
《评琴书屋医略》提要自叙凡例序附诗并各题赠卷一外感症春日外感夏日外感秋日外感冬日外感春温症(冬温同论症治)暑症附案(暑邪变疟)湿症泄泻症痢症附论时行传染二症疟症附案(暑邪变疟)又案(疟后辨寒热)卷二消
序卷一杂症述略卷二妇科述略胎前论治卷三产后述略
自序例言卷一禀赋源流总论摄养为本总论卷二阴阳脏腑总论卷三营卫经络总论卷四上四诊合参总论卷四下经解格阳关阴脉脉应四时阴阳脉候部位脉象辨病诊脉察色观形经脉应四时十二月五脏绝脉五脏脉象辨脉平病死旺之象辨平病
本草图经序本草图经奏敕玉石上品卷第一玉屑玉泉（图缺），文具玉屑条下。丹砂空青曾青（图缺），文附空青条下。绿青扁青，文具绿青条下。石胆云母石钟乳殷孽，文具石钟乳条下。孔公孽，文具石钟乳条下。石花，文具石